MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Escherichia coli O83:H1 str. NRG 857C chromosome

Total Repeats: 97494

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017634	TG	3	6	37	42	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017634	A	7	7	47	53	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017634	AGC	2	6	65	70	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_017634	CAGA	2	8	156	163	50 %	0 %	25 %	25 %	387615345
5	NC_017634	ACA	2	6	181	186	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387615345
6	NC_017634	CAC	2	6	204	209	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387615345
7	NC_017634	ACC	3	9	214	222	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387615345
8	NC_017634	ATCACC	2	12	223	234	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	387615345
9	NC_017634	A	6	6	280	285	100 %	0 %	0 %	0 %	387615345
10	NC_017634	T	9	9	308	316	0 %	100 %	0 %	0 %	387615345
11	NC_017634	AAC	2	6	336	341	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387615345
12	NC_017634	CGG	2	6	360	365	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387615346
13	NC_017634	CAGG	2	8	426	433	25 %	0 %	50 %	25 %	387615346
14	NC_017634	CT	3	6	451	456	0 %	50 %	0 %	50 %	387615346
15	NC_017634	ACCA	2	8	472	479	50 %	0 %	0 %	50 %	387615346
16	NC_017634	GAT	2	6	489	494	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387615346
17	NC_017634	A	6	6	497	502	100 %	0 %	0 %	0 %	387615346
18	NC_017634	CGC	3	9	576	584	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387615346
19	NC_017634	TCG	2	6	620	625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387615346
20	NC_017634	TTG	2	6	670	675	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387615346
21	NC_017634	CGCTG	2	10	699	708	0 %	20 %	40 %	40 %	387615346
22	NC_017634	CTG	2	6	802	807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387615346
23	NC_017634	CCG	2	6	855	860	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387615346
24	NC_017634	TGG	2	6	938	943	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387615346
25	NC_017634	ACT	2	6	965	970	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387615346
26	NC_017634	GGC	2	6	984	989	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387615346
27	NC_017634	TTG	2	6	1005	1010	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387615346
28	NC_017634	GTT	2	6	1074	1079	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387615346
29	NC_017634	TTC	2	6	1133	1138	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387615346
30	NC_017634	TGA	2	6	1239	1244	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387615346
31	NC_017634	GGC	2	6	1335	1340	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387615346
32	NC_017634	GC	3	6	1339	1344	0 %	0 %	50 %	50 %	387615346
33	NC_017634	GTG	2	6	1378	1383	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387615346
34	NC_017634	ATC	2	6	1395	1400	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387615346
35	NC_017634	TG	3	6	1441	1446	0 %	50 %	50 %	0 %	387615346
36	NC_017634	AAG	2	6	1490	1495	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387615346
37	NC_017634	GGT	2	6	1542	1547	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387615346
38	NC_017634	TCT	2	6	1642	1647	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387615346
39	NC_017634	GAT	2	6	1678	1683	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387615346
40	NC_017634	TCA	2	6	1707	1712	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387615346
41	NC_017634	GCT	2	6	1779	1784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387615346
42	NC_017634	GAA	2	6	1815	1820	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387615346
43	NC_017634	CTC	2	6	1867	1872	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387615346
44	NC_017634	GAA	2	6	1909	1914	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387615346
45	NC_017634	ATC	2	6	1973	1978	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387615346
46	NC_017634	TTG	2	6	1994	1999	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387615346
47	NC_017634	CCAG	2	8	2009	2016	25 %	0 %	25 %	50 %	387615346
48	NC_017634	GTT	2	6	2062	2067	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387615346
49	NC_017634	TCG	2	6	2092	2097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387615346
50	NC_017634	TAC	2	6	2104	2109	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387615346
51	NC_017634	GCG	2	6	2125	2130	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387615346
52	NC_017634	TGA	2	6	2220	2225	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387615346
53	NC_017634	TGA	2	6	2228	2233	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387615346
54	NC_017634	GAT	2	6	2356	2361	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387615346
55	NC_017634	ATTGAA	2	12	2437	2448	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	387615346
56	NC_017634	TGC	2	6	2453	2458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387615346
57	NC_017634	CGC	2	6	2487	2492	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387615346
58	NC_017634	CGA	2	6	2517	2522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387615346
59	NC_017634	CG	3	6	2532	2537	0 %	0 %	50 %	50 %	387615346
60	NC_017634	TGA	2	6	2553	2558	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387615346
61	NC_017634	TGA	2	6	2589	2594	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387615346
62	NC_017634	TAT	2	6	2692	2697	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387615346
63	NC_017634	TGC	2	6	2714	2719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387615346
64	NC_017634	GCT	2	6	2749	2754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387615346
65	NC_017634	GCG	2	6	2870	2875	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387615347
66	NC_017634	GGC	2	6	2923	2928	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387615347
67	NC_017634	CAA	2	6	2944	2949	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387615347
68	NC_017634	GGT	2	6	3112	3117	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387615347
69	NC_017634	ATGA	2	8	3134	3141	50 %	25 %	25 %	0 %	387615347
70	NC_017634	GCA	2	6	3213	3218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387615347
71	NC_017634	TGG	2	6	3250	3255	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387615347
72	NC_017634	TGA	2	6	3264	3269	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387615347
73	NC_017634	GAA	2	6	3272	3277	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387615347
74	NC_017634	CAT	2	6	3283	3288	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387615347
75	NC_017634	CAGC	2	8	3289	3296	25 %	0 %	25 %	50 %	387615347
76	NC_017634	TGA	2	6	3310	3315	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387615347
77	NC_017634	CGC	2	6	3392	3397	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387615347
78	NC_017634	ATTGC	2	10	3402	3411	20 %	40 %	20 %	20 %	387615347
79	NC_017634	TTCA	2	8	3434	3441	25 %	50 %	0 %	25 %	387615347
80	NC_017634	TGA	2	6	3480	3485	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387615347
81	NC_017634	AGCG	2	8	3571	3578	25 %	0 %	50 %	25 %	387615347
82	NC_017634	TCCGGC	2	12	3584	3595	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	387615347
83	NC_017634	TG	3	6	3612	3617	0 %	50 %	50 %	0 %	387615347
84	NC_017634	CGG	2	6	3711	3716	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387615347
85	NC_017634	T	6	6	3827	3832	0 %	100 %	0 %	0 %	387615348
86	NC_017634	CTGA	2	8	3857	3864	25 %	25 %	25 %	25 %	387615348
87	NC_017634	TGA	2	6	3868	3873	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387615348
88	NC_017634	TGA	2	6	3931	3936	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387615348
89	NC_017634	CG	3	6	3968	3973	0 %	0 %	50 %	50 %	387615348
90	NC_017634	CGG	2	6	4066	4071	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387615348
91	NC_017634	GGC	2	6	4259	4264	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387615348
92	NC_017634	TGA	3	9	4330	4338	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387615348
93	NC_017634	CTA	2	6	4411	4416	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387615348
94	NC_017634	GC	3	6	4448	4453	0 %	0 %	50 %	50 %	387615348
95	NC_017634	CGG	2	6	4500	4505	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387615348
96	NC_017634	CTG	2	6	4508	4513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387615348
97	NC_017634	TGC	2	6	4549	4554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387615348
98	NC_017634	ACG	2	6	4590	4595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387615348
99	NC_017634	GATG	2	8	4639	4646	25 %	25 %	50 %	0 %	387615348
100	NC_017634	AGCC	2	8	4649	4656	25 %	0 %	25 %	50 %	387615348
101	NC_017634	AAC	2	6	4658	4663	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387615348
102	NC_017634	GTT	2	6	4681	4686	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387615348
103	NC_017634	CCG	2	6	4687	4692	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387615348
104	NC_017634	GAT	2	6	4733	4738	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387615348
105	NC_017634	AG	3	6	4888	4893	50 %	0 %	50 %	0 %	387615348
106	NC_017634	CCG	2	6	4980	4985	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387615348
107	NC_017634	TGC	2	6	4990	4995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387615348
108	NC_017634	TGA	3	9	5007	5015	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387615348
109	NC_017634	ATC	2	6	5016	5021	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387615348
110	NC_017634	T	6	6	5077	5082	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017634	GAA	2	6	5085	5090	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017634	AAC	2	6	5169	5174	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387615349
113	NC_017634	TGG	2	6	5405	5410	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387615350
114	NC_017634	ACA	2	6	5413	5418	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387615350
115	NC_017634	CCG	2	6	5456	5461	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387615350
116	NC_017634	CGC	2	6	5466	5471	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387615350
117	NC_017634	ATC	2	6	5490	5495	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387615350
118	NC_017634	ATC	2	6	5502	5507	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387615350
119	NC_017634	CAT	2	6	5525	5530	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387615350
120	NC_017634	GTT	2	6	5591	5596	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387615351
121	NC_017634	GGA	2	6	5628	5633	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387615351
122	NC_017634	TCA	2	6	5638	5643	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387615351
123	NC_017634	AAG	2	6	5644	5649	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387615351
124	NC_017634	CAGT	2	8	5669	5676	25 %	25 %	25 %	25 %	387615351
125	NC_017634	AAT	2	6	5703	5708	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387615351
126	NC_017634	TCA	2	6	5717	5722	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387615351
127	NC_017634	TGA	2	6	5750	5755	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387615351
128	NC_017634	TTC	2	6	5770	5775	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387615351
129	NC_017634	TTC	2	6	5815	5820	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387615351
130	NC_017634	CAC	2	6	5862	5867	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387615351
131	NC_017634	TGC	2	6	5880	5885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387615351
132	NC_017634	TTG	2	6	5902	5907	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387615351
133	NC_017634	TGA	2	6	5909	5914	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387615351
134	NC_017634	AAATCG	2	12	6055	6066	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	387615351
135	NC_017634	AGCG	2	8	6173	6180	25 %	0 %	50 %	25 %	387615351
136	NC_017634	GCT	2	6	6263	6268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387615351
137	NC_017634	GTG	2	6	6304	6309	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387615351
138	NC_017634	A	7	7	6399	6405	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017634	CAT	2	6	6446	6451	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387615352
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148	NC_017634	GCCA	2	8	7130	7137	25 %	0 %	25 %	50 %	387615352
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154	NC_017634	CG	3	6	7649	7654	0 %	0 %	50 %	50 %	387615352
155	NC_017634	CAA	2	6	7783	7788	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387615352
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158	NC_017634	GCAT	2	8	7859	7866	25 %	25 %	25 %	25 %	387615352
159	NC_017634	AAG	2	6	7922	7927	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
160	NC_017634	TA	3	6	7928	7933	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
161	NC_017634	GGCG	2	8	7990	7997	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
162	NC_017634	CGG	2	6	8054	8059	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
163	NC_017634	CGT	2	6	8074	8079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
164	NC_017634	ATC	2	6	8083	8088	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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168	NC_017634	CGCAG	2	10	8263	8272	20 %	0 %	40 %	40 %	387615353
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220	NC_017634	ATA	2	6	10643	10648	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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247	NC_017634	TTA	2	6	11946	11951	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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250	NC_017634	A	6	6	12060	12065	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
251	NC_017634	TGA	2	6	12083	12088	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
252	NC_017634	TAG	2	6	12108	12113	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
253	NC_017634	AGTG	2	8	12122	12129	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
254	NC_017634	A	7	7	12137	12143	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
255	NC_017634	ATG	2	6	12199	12204	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
256	NC_017634	AT	3	6	12210	12215	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
257	NC_017634	AAT	2	6	12239	12244	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387615358
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262	NC_017634	TGGT	2	8	12376	12383	0 %	50 %	50 %	0 %	387615358
263	NC_017634	GCC	2	6	12451	12456	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387615358
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393	NC_017634	AAT	2	6	18327	18332	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387615362
394	NC_017634	A	6	6	18393	18398	100 %	0 %	0 %	0 %	387615362
395	NC_017634	ATA	2	6	18523	18528	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
396	NC_017634	AATGT	2	10	18529	18538	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
397	NC_017634	TTG	2	6	18664	18669	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387615363
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431	NC_017634	ATT	2	6	20180	20185	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387615364
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472	NC_017634	ACA	3	9	22348	22356	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
473	NC_017634	TTG	2	6	22372	22377	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387615366
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480	NC_017634	GCA	2	6	22812	22817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
481	NC_017634	TTC	2	6	22828	22833	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
482	NC_017634	CTT	2	6	22865	22870	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
483	NC_017634	TTAACC	2	12	22896	22907	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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500	NC_017634	TCTGGC	2	12	23484	23495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387615367

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